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自2024年1月1日起，马来西亚电子发票系统进入第二阶段推行，然而技术问题、指引不明确及物流瓶颈等因素令企业面临诸多挑战。
这一阶段的主要对象为年营业额在2500万令吉至1亿令吉之间的企业。尽管部分企业已顺利完成过渡，但仍有一些企业因准备不足而受到影响。马来西亚中型企业联盟会长洪美真指出，税务局（LHDN）未能提供明确指引，加之企业在获取供应链信息（如税务识别号码）方面的困难，是导致问题的主要原因之一。
系统升级成本高企
此外，现有业务系统与税务局的技术要求不匹配，迫使企业在培训和基础设施升级上投入巨额成本。洪美真表示：“现行的企业支持系统大多不符合要求，必须进行改造，而这将带来巨大开支。如果政府能够提供补贴或税务减免，无疑将缓解企业负担。”他还呼吁税务局提供免费或补贴培训，尤其是在供应链环节，以加速电子发票系统的全面推行。
与此同时，马来西亚中华总商会总财政孔令龙指出，电子发票系统的实施在数据安全方面引发了担忧。“目前，企业需委任一名代表处理电子发票相关事务，但这一角色通常由普通员工担任。这导致这些员工可能接触到企业机密信息，包括所得税申报表等，”他表示。他建议税务局采取有效措施，限制代表的访问权限，仅限于电子发票相关内容。
自开票系统复杂
针对强制推行的自开票系统，孔令龙批评其过于复杂，特别是对中小企业而言，可能导致操作失误及罚款。他呼吁政府推迟该系统的实施，直至企业能够完全适应电子发票的使用。
中小企业税务服务商黄丽芬（音译）也提出，许多企业在调整运营流程以配合自开票系统时遇到困难。“这一变革需要时间来让企业完成对接。至少应设定合理的过渡宽限期，以缓解企业压力，”她说。
企业管理解决方案供应商Fast Track Sboi有限公司总监洪杰瑶（音译）则强调，加强税务局与解决方案供应商之间的协作尤为重要。“税务局应提前公布系统更新计划，避免在临近截止日期时才发布更新，给企业和解决方案供应商带来不必要的压力。”他建议税务局为供应商和用户提供专门测试环境，确保在正式推行新版本前完成试用和反馈优化。
技术瓶颈与资源匮乏
此外，Monitor ERP System Asia销售总监泰瑞尔·泰指出，税务局MyInvois平台存在技术问题，特别是文件大小限制对处理复杂发票的企业构成挑战。“一些企业不得不将发票手动分割成多个文件，这无疑增加了行政工作量和时间成本，”他说。
泰瑞尔补充道，许多中小企业缺乏必要的IT基础设施和技术能力，难以适应电子发票系统的管理需求。他呼吁政府加大支持力度，提供相关培训和资源，帮助企业更顺利地完成转型。
